台北車站地下一層電扶梯口與地下街入口交會，觀察五分鐘，就有三個人問掃地中的清潔人員，「ｘｘｘ怎麼走？」問路，是北車的日常風景。
桃園機場捷運春節後試營運並通車，機捷Ａ１站位在市民大道、重慶南路交接處，搭乘台北捷運、台鐵或高鐵的民眾，無法從台北車站內轉乘機捷，須拉著行李通過地下一層西側連通道，步行到機捷站。
原本三鐵共構的台北車站動線複雜，被民眾封為「全台最大迷宮」，民眾擔心機捷加入，北車會升級成更恐怖的迷魂陣，進得去、出不來。桃捷公司總經理陳凱凌說，機捷用紫色車頭的企業識別標示牌，應不會有迷路問題。
桃園市長鄭文燦也說，不只北車站內，履勘委員也要求加強站外引導。桃捷公司則表示，通車後會視旅客動線是否順暢，再研擬是否要增設引導。
台鐵局表示，因應機捷加入營運，台北車站總共更新了八十六面標示；包括車站一樓及地下一樓更新七十面吊掛燈箱，台鐵月台也更新十六面壁貼。
台北車站三鐵共構，但有各自的標誌系統，在一樓、Ｂ１公共區是台鐵標誌；Ｂ１及Ｂ３的高鐵付費區是高鐵標示系統；Ｂ３、Ｂ４標誌是台北捷運系統。對於標誌問題，高鐵工程局主任秘書楊正君說，「標誌永遠都有進步空間，一直在改進。」
交通部表示，台北市政府有智慧化投資營運案，要將台北車站智慧化，明年世大運前建置人行指標導引、藍芽導航App等系統，或許能改善問題。
去年台鐵的資訊高手自己寫程式，開發使用時不必連上網的簡易導航，只花五萬元做地磚貼紙，成本超低。可惜去年中央政府要求清理官方機關下載率過低的App，公開僅三個月的導航App下載六、七千次尚未達標，加上台鐵大廳翻修地板而下架，未能擴及使用範圍至高鐵、北捷。